Deteksi Vibrio Harveyi dengan Metode Amplifikasi DNA pada Gen ToxR

Calvin Wijaya Johan • Dwi Putra, Sulistyo Emantoko • Ernest Suryadjaja
Journal article Keluwih: Jurnal Sains dan Teknologi • 2020

Unduh teks lengkap
(9 pages)

Abstrak

-Infeksi hewan akuakultur oleh Vibrio harveyi dapat menyebabkan kematian serta kerugian ekonomi. Kemampuan untuk mendeteksi bakteri tersebut secara dini dapat mencegah penyebarannya dalam akuakultur. Penelitian ini bertujuan untuk mengembangkan metode untuk mendeteksi Vibrio harveyi melalui amplifikasi gen toxR. Amplifikasi DNA dilakukan dengan dua metode, yakni amplifikasi isotermal termediasi loop (loop-mediated isothermal amplification, LAMP) dan reaksi berantai polimerase (PCR). Amplifikasi menggunakan metode LAMP menunjukan perlu dilakukan optimasi protokol maupun desain primer untuk mencegah perolehan hasil false positive. Amplifikasi menggunakan metode PCR menghasilkan produk berukuran 229 pasang basa yang spesifik pada Vibrio harveyi dengan batas deteksi hingga 0,526 ng.µL-1 (setara 2,09 × 106 CFU.mL-1). Kata kunci: Akuakultur, LAMP, PCR, toxR, Vibrio harveyi

Metrik

  • 0 kali dilihat
  • 1 kali diunduh

Jurnal

Keluwih: Jurnal Sains dan Teknologi

Keluwih: Jurnal Sains dan Teknologi (JKST; English: Keluwih: Journal of Science and Technology) i... tampilkan semua