Virus Culture and Real-time RT-PCR in Identifying Influenza Viruses From Influenza-like Illness Cases in Indonesia 2007-2008

Indalao, Irene L • Setiawaty, Vivi • Pawestri, Hana A • Subangkit, Subangkit
Artikel jurnal Health Science Journal of Indonesia • Desember 2011 Indonesia • USA

Abstrak

Latar belakang: Adanya perbedaan hasil antara kultur virus dengan real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) yang digunakan dalam surveilans influenza-like illness (ILI) menunjukkan perlunya mengevaluasi hasil kultur virus yang didapatkan dengan hasil RT-PCR sebagai pembanding.Tujuan penelitian ini adalah untuk mengevaluasi apakah kultur virus masih dapat diandalkan untuk studi surveilans ILI.Metode: Usap hidung dan USAp tenggorok didapatkan dari 20 sentinel ILI di Indonesia selama tanun 2007-2008. Identifikasi kultur virus dilakukan dengan menggunakan metode hemaglutinasi dan hemaglutinasi inhibisi. RT-PCR menggunakan primer yang bersifat spesifik untuk influensa A (A/H1N1, A/H3N2 and A/H5N1) dan influensa B. Primer disediakan oleh Center for Disease Control and Prevention, USA. Hasil positif kultur virus dibandingkan dengan hasil RT-PCR berdasarkan persentase kesamaan hasil.Hasil: Sebanyak 112 spesimen dari 4277 spesimen kasus ILI didapatkan hasil positif influenza dengan metode kultur. Kesamaan hasil positif influenza kultur virus dibandingkan dengan real-time RT-PCR adalah 69.6%. Pada penelitian ini juga ditemukan bahwa 30,4 % (n=112) hasil real-time RT-PCR yang ditemukan positif influenza tidak dapat dideteksi oleh metode kultur.Kesimpulan: Metode kultur masih relevan untuk surveilans ILI meskipun hasil positif Influenza dari kultur virus lebih sedikit dari pada hasil positif Influenza yang terdeteksi dengan metode PCR. (Health Science Indones 2011;2:92-5).

Metrics

  • 49 kali dilihat
  • 16 kali diunduh

Jurnal

Health Science Journal of Indonesia

Health Science Journal of Indonesia merupakan jurnal Internasional terbitan Badan Penelitian dan ... tampilkan semua